Mulai tanggal 13 februari 2023 RSUD Kesesi mulai menerima pasien rujukan dari Puskesmas se-Kab Pekalongan untuk Rawat Jalan, Rawat Inap dan Tindakan operatif.
Sehubungan belum adanya kerjasama dengan BPJS, maka RSUD Kesesi hanya menerima pasien Program Bupati Pekalongan Pelayanan Kesehatan Gratis, yaitu pasien yang ber-KTP Kabupaten Pekalongan, dan Tidak menjadi Peserta BPJS.
Dan RSUD Kesesi juga melayani pasien umum.