Masalah kesehatan yang cukup besar dan mengancam Indonesia serta banyak negara di seluruh dunia adalah HIV/AIDS. HIV sendiri adalah virus yang menyerang sistem kekebalan tubuh, sementara AIDS adalah kondisi ketika HIV sudah pada tahap infeksi akhir. Di Kabupaten Pekalongan pada laporan situasi perkembangan HIV/AIDS tahun 2024 didapatkan data bahwa jumlah ODHA yang ditemukan dan dilaporkan mencapai 111 kasus, jumlah tersebut menurun jika dibandingkan pada tahun sebelumnya yakni 119 di tahun 2023.